Die Geschichte der Protestanten in Lyon ist verwurzelt und komplex. Seit dem 16. 1500er-Jahre gab es eine bedeutende reformierte Gemeinde, die zunächst im Geheimen operierte, um der Repression zu entgehen. Lyon, als wichtiges drehkreuz, zog Menschen aus ganz Europa an, darunter viele huguenottische Flüchtlinge. Während des Edikts von Nantes (159